離子交換和軟化樹脂是常見的水處理材料，其保存措施也很重要，下面來介紹兩種情況的保存，未使用的樹脂儲存和運行過樹脂保存：
1、未用過離子交換樹脂的保存方法： 
離子交換樹脂在*儲存中，或需在停用設備內*存放，強型樹脂（強酸性和強堿性樹脂）應轉為鹽型，弱型樹脂（弱酸性和弱堿性樹脂）可轉為相應的氫型或游離胺型，也可轉變為鹽型，以保持樹脂性能的穩定。然后浸泡在潔凈的水中。停用設備若須將水排去，則應密封，以防樹脂中水份散失。離子交換樹脂內含有一定的平衡水份，在儲存和運輸中應保持濕潤，防止脫水。樹脂應儲存在室內或加遮蓋，環境溫度以5°C-40°C為宜。袋裝樹脂應避免直接日曬，遠離鍋爐、取暖器等加熱裝置，避免脫水。　　若發現樹脂已有脫水現象，切勿將樹脂直接放于水中，以免干樹脂遇水急劇溶脹而破碎。應根據其脫水程度，用10%左右的食鹽水慢慢加入到樹脂中，浸泡數小時后用潔凈水逐步稀釋。當環境溫度在0°C或以下時，為防止樹脂因內部水份結冰而崩裂，應做好保溫措施，或根據氣溫條件，將樹脂存于相應濃度的食鹽水中，防止冰凍。若發現樹脂已被凍，則應讓其緩慢自然解凍，切不可用機械力施于樹脂。食鹽溶液濃度與冰點的關系如下表： 濃度 5% 10% 15% 20% 23.5% 冰點 -3°C -7°C -10.8°C -16.3°C -21.2°C 
2、使用過樹脂保存方法： 
*停用而放置在交換器內的樹脂，為防止微生物（如藻類、細菌等）對樹脂的不可逆污染，樹脂在停用前須*反洗，以除去運行時積聚的懸浮物質，并注意定期沖洗和換水。
陰樹脂：用3倍樹脂體積的10%NaCl 2%NaOH混合液分兩次通過樹脂層，每次靜止浸泡數小時，然后將其排去。如有必要，在重新啟動前用2倍樹脂體積的0.2%過氧化氫（H2O2）溶液淋洗樹脂層。
陽樹脂：在陽離子交換器及管系內可充入0.5%的甲醛溶液，并在停用期間保持此濃度。也可用食鹽水浸泡。在設備重新啟動前用0.2%過氧化氫或0.5%甲醛溶液淋洗。